“南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室”（以下简称“果树工程实验室”）于2016年10月18日通过国家发展改革委员会通过立项建设。“工程实验室”立足新疆果树产业发展的重大战略需求和新技术发展的前沿，以技术研发和成果转化并重的发展思路，以培养创新型人才、服务区域经济建设、推动产业发展为己任，以新疆特色果树优质生产及林果产品的贮藏加工与质量安全控制关键技术与产品为突破口，以原创性成果和自主知识产权获取、成果转化、服务地方为发展目标，践行协同创新模式，打造“产、学、研、用”一体化、产业化示范基地。

“工程实验室”实验室面积6000平米，现有固定人员57人、流动研发人员33人，研究生150余名。设有特色果树种质资源与品种选育研究、果树高效优质栽培技术研究、果树有害生物综合防控技术研究、果产品贮藏加工及质量安全控制技术研究四个方向。拥有仪器设备1751台（件），仪器设备原值2560万元，其中进口设备215台（件），大型仪器设备48台件（单价10万元以上），仪器设备共享率100%。近3年划拨专项基金用于资助开放课题，资助开发课题13项。近3年参加国内外86个学术会议，其中在国内会议做36报告人次。

近3年果树实验室共承担各类科研计划项目126项，项目经费合计3623.53万元，其中，国家级科研项目18项、国际合作项目1项、省部级科研项目78项。近3年实验室获得成果7项；发表论文142篇，其中SCI收录22篇，中文核心期刊72篇，普刊47篇。获授权专利27项，其中发明专利8项，实用新型专利19项。